I: Biobibliografija

• IA Kučinskas, Antanas. Prof. Kun. Dr. Jonas Totoraitis [su bibliografija]. In: Athenaeum. IV metai (1933), t. 4, p. 1–16.
• IA Prof. Jono Totoraičio bibliografija. In: Katilius, Algimantas. Jonas Totoraitis MIC: biografija ir veikla. – Vilnius: Lietuvos istorijos institutas, 2022, p. 203–225. 

II: Egodokumentika

• LI Kunigo Jono Totoraičio užrašai apie 1905-1906 metų įvykius Lietuvoje. In: Lietuvių katalikų mokslo akademijos metraštis. T. 22 (2003), p. 481–503.
• LI Kunigo Jono Totoraičio MIC laiškai kunigui Pranciškui Bučiui MIC. In: Terra Jatwezenorum. T. 6 (2014), p. 224–251.

III: Kūryba (be visuomeninių straipsnių ir pamokslų)

• IA Totoraitis, Johann. Die Litauer unter dem König Mindowe bis zum Jahre 1263: Dissertation. – Freiburg: [s.n.], 1905. – 160 p.
• IA Totoraitis, J. Senovės liekanos ir lietuvių mitologiški atminimai. In: Lietuvių tauta. T. 1. Kn. 2 (1908), p. 177–204.
• EP Totoraitis, J. Vyskupo Baranausko rankraščiai Leipcige. In: Draugija. Nr. 48 (1910), p. 381–385.
• EP Totoraitis, Jonas. Jaunimo globa ir jo susivienijimai. – Seinai: [s.n.], 1910. – II, 120 p. [Prieš tai skelbta: Vadovas. Nr. 1-16 (1908)]
• Totoraitis, J. Lietuvos atgimimo paveikslai:

EP D. 1: Basanavičius. In: Vadovas. Nr. 39 (1911), p. 258–267.

EP D. 2: Basanavičius. In: Vadovas. Nr. 40 (1911), p. 366–375.

EP D. 3: Basanavičius. In: Vadovas. Nr. 41 (1912), p. 54–63.

EP D. 4: Basanavičius. In: Vadovas. Nr. 43 (1912), p. 245–253.

EP D. 5: Basanavičius. In: Vadovas. Nr. 44 (1912), p. 373–379.

EP D. 6: Basanavičius. In: Vadovas. Nr. 45 (1912), p. 52–59.

EP D. 7: Senesnieji mūsų rašytojai. In: Vadovas. Nr. 46 (1912), p. 157–168.

EP D. 8: Senesnieji mūsų rašytojai. In: Vadovas. Nr. 47 (1912), p. 236–245.

EP D. 9: Senesnieji mūsų rašytojai. In: Vadovas. Nr. 48 (1912), p. 364–376.

EP D. 10: Šliūpas. In: Vadovas. Nr. 51 (1912), p. 267–277.

EP D. 11: Prūsų Lietuva. In: Vadovas. Nr. 53 (1913), p. 91–101.

EP D. 12: Prūsų Lietuva. In: Vadovas. Nr. 54 (1913), p. 206–216.

EP D. 13: Prūsų Lietuva. In: Vadovas. Nr. 55 (1913), p. 316–322.

EP D. 14: Lietuviai svetur. In: Vadovas. Nr. 56 (1913), p. 419–431.

EP D. 15: Lietuviai svetur. In: Vadovas. Nr. 57 (1913), p. 68–71.

EP D. 16: Įvairios apie Aušrą. In: Vadovas. Nr. 61 (1913), p. 79–87.

EP D. 17: Lietuvos stovis Aušros laiku. In: Vadovas. Nr. 63 (1913), p. 283–292.

EP D. 18: Aušros rašytojai, istorija, pakraipa, intekmė. In: Vadovas. Nr. 68 (1914), p. 235–249

EP D. 19: Lietuvos atgijimo priežastys. In: Vadovas. Nr. 76 (1914), p. 189–200.

• EP Totoraitis, J. Kova ties Žalgiriu. In: Žiburio kalendorius 1911 metams. – Seinai: [„Žiburio“ draugija], 1912, p. 37–48.
• EP Totoraitis, J. Rekolekcijos. In: Vadovas. Nr. 25 (1910), p. 43–50.
• EP Totoraitis, J. Šv. Ignacijaus „Exercitia spiritualia“ (rekolekcijos). Vadovas. Nr. 36 (1911), p. 368–373.
• Totoraitis, J. Konferencijos kunigų rekolekcijoms:

EP D. 1. In: Vadovas. Nr. 49 (1912), p. 41–60.

EP D. 2. In: Vadovas. Nr. 50 (1912), p. 130–149.

EP D. 3. In: Vadovas. Nr. 59 (1913), p. 287–294.

EP D. 4. In: Vadovas. Nr. 60 (1913), p. 374–399.

EP D. 5. In: Vadovas. Nr. 71 (1914), p. 173–180.

EP D. 6. In: Vadovas. Nr. 72 (1914), p. 240–255.

EP D. 7. In: Vadovas. Nr. 73 (1914), p. 18–24.

• EP Totoraitis, J. Iš mūsų atgijimo istorijos. In: Ateities spinduliai. 1916, nr. 1, p. 37–44.
• Totoraitis, J. Kun. Silvestras Gimžauskas:

EP D. 1. In: Ateities spinduliai. 1916, nr. 2-3, p. 86–90.

D. 2. In: Ateities spinduliai. 1916, nr. 5-6-7, p. 202–208.

• Totoraitis, J. Krikščionybės pradžia Lietuvoje ir pirmoji vyskupija:

EP D. 1. In: Ganytojas. 1920, nr. 1, p. 5–10.

EP D. 2. In: Ganytojas. 1920, nr. 2, p. 35–40.

• IA Totoraitis, Jonas. Lietuvos atgijimas [1863-1883 m.]. – Chicago: Draugas, [1922]. – 128 p. [Prieš tai skelbta: Draugas, 1921, nr. 280-288]
• Totoraitis, Jonas. Naujųjų amžių istorija. – Marijampolė: [s.n.], 1923. – 243, [3] p.
  • Kučinskas, Antanas; Totoraitis, Jonas. Naujųjų amžių istorija: vadovėlis aukštesnėms klasėms. – Marijampolė: Sakalas, 1939. – 270 p.
• IA Totoraitis, Jonas. Marijampolės kunigų Marijonų vienuolynas. – Marijampolė: [Marijonų kongregacija], 1924. – 71, [8] p.  
  • Szwernicki, Krzysztof. Wyjątki z dziennika podróży odbytej przez ks. Krzysztofa Szwernickiego w Krajach Amurskich, w Prowincji Irkuckiej i Gubernii Irkuckiej, dla spełnienia posług duchownych katolikom od d. 26 marca 1859 r. do d. 25 stycznia 1860 r.; Totoraitis, Jonas. Klasztor mariampolskich księży Marianów / tłumaczenie z litewskiego Bolesław Jakimowicz. – Hereford: Congregatio CC.RR. Marianotum, 1964. – 60, 34 p. (Collectanea Mariana Provinciae Americanae Sancti Stanislai Kostkae, nr. 10)
• IA Totoraitis, Jonas. Inkvizicija. In: Ateitis, 1926, nr. 1, p. 28–38.
• EP Totoraitis, J. Šiek tiek apie K. P. Būčio veikimą. In: Tiesos kelias. 1927, nr. 1 (straipsnių dalis), p. 17–23.
• Totoraitis, Jonas. Vidurinių amžių istorija. – Marijampolė: [s.n.], 1926. – 223 p.
  • IA Totoraitis, Jonas. Vidurinių amžių istorija. – 2-a papildyta ir iliustruota laida. – Marijampolė: [s.n.], 1930. – 280 p.
• EP Totoraitis, J. Albertas Vijukas-Kojalavičius. In: Tiesos kelias. 1928, nr. 1 (straipsnių dalis), p. 15–18.
• EP Totoraitis, J. Dešimties metų Rygiškių Jono gimnazijos sukaktuvės. In: Šaltinis. 1928, nr. 6, p. 82–86.
• Totoraitis, J. Naujųjų amžių istorija:

[D. 1]: Karai dėl Italijos (1492-1559) ir renesansas: paskaitos, skaitytos 1928 m. rudens semestre. – [Kaunas: s.n., 1928]. – 118 p. [padaugintas mašinraštis]

[D. 2]: Reformacijos laikas; pabaiga XV iki vidurio XVI šimtmečio: paskaitos, skaitytos 1929 m. pavasario semestre. – [Kaunas: s.n., 1929]. – 152 p. [padaugintas mašinraštis]

EP [D. 3]: Tridento koncilija, Kat. bažnyčios atgijimas, Filypas II ir kt.: paskaitos, skaitytos 1929 m. rudens semestre. – [Kaunas: s.n., 1929]. – 109 p. [padaugintas mašinraštis]

[D. 4]: Laikotarpis nuo 1749 iki 1815 m. – [Kaunas: s.n., 1930]. – 50 p. [padaugintas mašinraštis]

[D. 5]: Nuo Vienos kongreso lig prancūzų-vokiečių karo (1815–1871): skaityta 1928 m. pavasario semestre. – [Kaunas: s.n., 1929]. – 155 p. [padaugintas mašinraštis]

• Totoraitis, J. Istorijos metodologijos užrašai: paskaitos, skaitytos 1929 metų pavasario semestre Lietuvos universitete. – Kaunas: D. Pučinskis, 1929. – 67 p. [padaugintas mašinraštis]
• EP Totoraitis, J. Zanavykų istorija. – Marijampolė: Marijonų vienuolijos leidinys, 1929. – 104 p.
• IA Totoraitis, J. Vytautas katalikas. – Marijampolė: [s.n.], 1930. – 54 p. [Prieš tai skelbta: Šaltinis, 1930, nr. 24–30]
• SP Totoraitis, J. Normanai Rytų Europoje. In: Ateitis. 1930, nr. 4, p. 151–156.
• Marijonų vienuolija. – Marijampolė: [Marijonų kongregacija], 1931. – 63 p. 
• IA Totoraitis, J. Mindaugas – Lietuvos karalius. – Marijampolė: Marijonų kongregacija, 1932. – 124 p. [Prieš tai skelbta: Šaltinis, 1931, nr. 30–52]
• IA Totoraitis, Jonas. Marijonų vienuolijos atnaujintojas. In: Arkivyskupas Jurgis Matulevičius / redaktorius Kazimieras Čibiras. – Marijampolė: [Marijonų vienuolija], 1933, p. 39–45.
• IA Totoraitis, J. Žemaičių Kalvarija. – Marijampolė: [Marijonų kongregacija], 1936. – 73, [7] p.
• IA Totoraitis, Jonas. Būdingieji Sūduvos arba Užnemunės istorijos bruožai. In: Lietuvių katalikų mokslo akademijos suvažiavimo darbai. II. 1936 (1937), p. 259–282.
• Totoraitis, Jonas. Marijonų vienuolija nuo 1864 m. iki atsigavimo:

EP D. 1: In: Tiesos kelias, 1936, nr. 9 (straipsnių dalis), p. 457–469.

EP D. 2. In: Tiesos kelias, 1936, nr. 10 (straipsnių dalis), p. 525–542.

EP D. 3. In: Tiesos kelias, 1936, nr. 11 (straipsnių dalis), p. 605–619.

• Totoraitis, Jonas. Marianie na Suwalszczyźnie / tłumaczenie z litewskiego Bolesław Jakimowicz. – Stockbridge: Zgromadzenie XX. Marianów, 1964. – 47 p. [vertimas papildytas Tiesos kelyje neskelbta dalimi]
  • IA Totoraitis, Jonas. Zakon Marianów od kasaty do odnowienia / tłumaczenie z litewskiego Bolesław Jakimowicz. – [Wydanie 2-ie]. – Warszawa: Mariański Instytut Historyczny, 2002. – 117 p. (Studia Marianorum, t. 4)
• IA Totoraitis, Jonas. Sūduvos Suvalkijos istorija. D. 1. – Kaunas: Vytauto Didžiojo universiteto Teologijos-filosofijos fakulteto leidinys, 1938. – IV, 702, [2] p.
  • Totoraitis, Jonas. Sūduvos Suvalkijos istorija. – Fotografuotas leidimas. – Marijampolė: Piko valanda, 2003. – 726, [2] p.
• EP Totoraitis, J. Vatikano archyve. In: Tiesos kelias, 1938, nr. 7-8 (straipsnių dalis), p. 498–502.
• Totoraitis, J. Vilniaus vyskupų reliacijos XVIII a.

EP D. 1. In: Tiesos kelias, 1939, nr. 2 (straipsnių dalis), p. 81–90.

EP D. 2. In: Tiesos kelias, 1939, nr. 3 (straipsnių dalis), p. 169–175.

EP D. 3: Mikalojus Pacas – Žemaičių vyskupas (1609-1619). In: Tiesos kelias, 1939, nr. 6 (straipsnių dalis), p. 443–452.

• EP Totoraitis J. Benedictus Voina promovendus ad Episcopatum Vilnensem (1600 m.). In: Tiesos kelias, 1939, nr. 4 (straipsnių dalis), p. 271–282.
• EP Totoraitis J. Merkelis Geišas Žemaičių vyskupas 1631-1633 m. In: Tiesos kelias, 1939, nr. 7/8 (straipsnių dalis), p. 543–550.
• IA Totoraitis, Jonas. Lenkų išleistieji Vatikano archyvo istorijos šaltiniai. In: Lietuvių katalikų mokslo akademijos suvažiavimo darbai. III. 1939 (1940), p. 342–349.
• IA Totoraitis, J. Žemaičių vyskupas Aleksandras Sapiega. In: Lietuvos praeitis. T. 1, sąs. 1 (1940), p. 101–107.
• IA Totoraitis, J. Žemaičių vyskupas Aleksandras Gorainis ir didysis maras 1716-1735 m. In: Lietuvos praeitis. T. 1, sąs. 2 (1941), p. 605–614.

V: Apie J. Totoraitį

• IA Katilius, Algimantas. Jonas Totoraitis MIC: biografija ir veikla. – Vilnius: Lietuvos istorijos institutas, 2022. – 276 p.
• IA Prof. dr. Jonas Totoraitis gyvenime ir atminty / sudarė Paulina Danutė Vidrinskienė. – Marijampolė: Knygrišykla, 2012. – 78 p.
• LI Selenis, Valdas. Bažnyčios istorija Vytauto Didžiojo universiteto Teologijos-filosofijos fakulteto profesorių Antano Aleknos ir Jono Totoraičio apibendrinamojo pobūdžio darbuose. In: Soter. T. 39(67) (2011), p. 83–94.

Parengta 2024-08-06